嫁接是繁殖牡丹简易而有效的方法，不论单位或个人均可进行。牡丹嫁接季节性很强，宜在9月中旬至10月上旬进行，否则会因节令推迟而成活率递减。
一、砧木的准备
嫁接牡丹最好选用芍药根作砧（用播种的牡丹二年生苗亦可），规格：长15厘米-20厘米，粗（大头直径）1.5厘米-2厘米，要求砧根光滑（有无须根均可）无病虫害。芍药根运来后，要整理成捆用湿沙埋藏，以免失水。嫁接前将砧根从沙中取出晾晒1天，待根梢变软再用以嫁接，这样不仅可避免砧根断裂，嫁接后砧根在土壤中吸水后变硬，使接口更紧密。
二、接穗的采取
接穗要选牡丹优良品种从地面发出的“土芽”或当年生短枝。要求枝条充实，顶芽较饱满，长8厘米-10厘米，粗0.8厘米-1厘米，顶芽以下要1个-2个侧芽。接穗剪采后，可用2‰的高锰酸钾或1%的硫酸铜溶液浸泡1小时后捞出，放于盆中湿布盖好备用。
三、嫁接操作方法
嫁接工作必须于10月上旬以前完成。嫁接时用接刀在芍药根上部平削一刀，使成为平滑的断面。然后从断面半径处垂直下削长2厘米-2.5厘米、深0.6厘米-0.8厘米的接口。削接穗时最好在下部芽的两侧削成长1.5厘米-2厘米一边厚、一边薄状如手术刀的削面，然后将削好的接穗自上而下插入砧根的削口，使两者密接吻合。接后用麻纰（不可用塑料条或尼龙丝）自上而下将接口缠紧，用充分搅拦的泥桨涂抹接口。
四、按接苗的栽植
嫁接时，每接完一个品种要放置一处，并做好标记。然后在预先整好的圃地每隔40厘米开一条宽15厘米、深25厘米的栽植沟。如土壤比较干燥，要先在沟内浇水至半深，待水渗下，再按株距15厘米（行距已在开沟时确定为40厘米）、接口与地面齐平进行栽植，地面露出接穗3厘米-4厘米。每栽好一行即在露出土面的接芽上封一屋脊状土埂，可起到保湿、防寒作用。
五、嫁接苗的管理
嫁接苗栽植后，接口有20天-30天的愈合期，在此期间不可浇水。以后可视天气情况，每月在栽植沟内浇一次水。第二年2月下旬，牡丹嫁接苗开始发芽，可在土埂南侧稍稍扒去一些土，使芽露出。待嫁接苗绝大部分发芽后（其间由于种种原因少量植株不发芽），即可按一般苗木进行管理，进行松土、除草、浇水。由于芍药砧根含有较多的养分，嫁接后的半年内可以不必追肥，但到秋末冬初则必须补充肥料。如此培养2年，嫁接苗即可出圃进行移植。
