症状：叶上发病。初生暗褐色的小斑点，后成周边暗褐色而中心灰白色、直径2～4毫米的病斑。多在下部叶上发病，严重时叶卷枯。病斑表面有暗绿色霉状物。
病原物CercosporazinniaeEllisetMartin为百日菊尾孢菌，属真菌半知菌亚门。
传染途径以菌丝块在种子或病残体上越冬，也可在温室栽培的病株上越冬，成为初侵染来源。病斑上的病菌也可通过风、雨、园艺操作来传播。
百日草发病条件高温高湿条件有利于病害发生。该病发病的适宜温度为22～28℃，相对湿度85％以上。但高温干旱而夜间结露的情况下，也易发病。此外，缺肥、缺水，或大水漫灌，生长不良等都容易发病。
百日草防治方法
1、加强管理施足肥料，培育壮苗，防雨遮荫，定植后适时浇水，防止大水漫灌。加强棚室通风，降低湿度。及时清除病残体。
2、药剂防治发病初期，及时摘除病叶，然后立即喷药防治，可用1：0.5:200倍的波尔多液加0.1%硫磺粉,或65%代森锌可湿性粉剂500倍,或75%百菌清可湿性粉剂500～800倍,或50%代森铵800～1000倍。
百日草黑斑病
百日草黑斑病又称褐斑病。在全国各地均有发生。被侵染植株的叶子变褐干枯，花瓣皱缩，影响观赏。
症状:叶、茎、花均可遭受此病危害。叶片上最初出现黑褐色小斑点，不久扩大为现规则形状的大斑，直径为2毫米～10毫米，红褐色。随着斑点的扩大和增多，整个叶片变褐干枯。茎上发病从叶柄基部开始，纵向发展，成为黑褐色长条状斑。花器受害症状与叶片相似，不久花瓣皱缩干枯。幼苗期，茎的基部受害时，形成深褐色中心下陷的溃疡斑，病斑逐渐包围茎部，使小苗呈立枯病症状
病原：为真菌百日草链格孢AlternariazinniaePa-pe。
侵染途径：此病菌在病叶、病茎等残体上越冬。带病的也可能成为初次侵染源。病菌借风雨传播，在百日草整个生长过程中都可侵染。特别是在高温多湿的气候条件下，发病最为严重。
防治方法：
1、选择排良好的地段种植。栽植密度要适当。避免连作。种子播前要进行消毒处理（用50％多菌灵可湿性粉剂1000倍液侵种10分钟）。秋后，病叶、病茎等集中销毁，消灭来年的侵染源。从无病的健康母株上留种。
2、用50％代森锌或代森锰锌5000倍液或80％新万生右湿粉剂600倍液喷雾。喷药时，要特别注意叶背表面喷匀。
百日草花叶病（CMV）
全国各地均有发生，常常引起植株矮小、退化，观赏性下降。
症状：发病初期叶上片呈轻微的斑驳状，以后成为深浅绿斑驳症。新叶上症状更为明显。
病原：引起百日草花叶病的病毒主要是黄瓜花叶病毒CMV。
传染途径：此病毒病可以由多种蚜虫传播，黄瓜花叶病毒的寄主范围很广，而且百日草生长季节又是蚜虫活动期，蚜虫与病害的发生有很大的相关性。
防治方法：灭蚜防病对百日草花叶病有一定的控制作用。另外，也要注意田间的卫生管理，根除病株，清除CMV的其它寄主，以减少侵染源。
