1、碗莲腐烂病
症状：病害发生于全株，从种根开始发病，延及地下茎、叶柄、叶片及花梗等部位。地下茎初期似无症状，但其断面导管有的变为淡褐色或褐色，并逐渐扩展。有的病茎变色不显著，但茎的全面或一侧发生纵皱，病茎所生叶片呈淡绿色，以后从叶缘开始干枯，引起叶片卷缩以至枯死。
传播途径和发病条件：以菌丝体在种藕内和以厚垣孢子在土壤中越冬，带菌的种藕和病土成为主要初侵染源。栽植带菌种藕，长出的幼苗则成为中心病株，先是地下茎秆及根系发生病变，后波及叶柄和叶片，中心病株产生孢子从伤口侵入，形成再侵染。品种间抗性有差异，深根系品种较浅根系品种发病轻，阴雨连绵、日照不足或暴风雨频繁易诱发此病;藕田土壤通透性差或酸性大，污水入田或水温高于35℃，都易诱发此病。
防治方法：①因地制宜选用抗病品种。②重病田宜实行2～3年轮作。③精选无病种藕，并用50%多菌灵或甲基硫菌灵可湿性粉剂800倍液加75%百菌清可湿性粉剂800倍液，喷雾后闷种，覆盖塑料薄膜密封24h，晾干后栽植。④藕田深耕翻耙，每公顷施石灰1500～2250kg。⑤加强肥水管理，施足腐熟有机肥，适时适量追肥，做到有机肥和化肥相结合，氮肥与磷钾肥相结合;按莲藕不同生育阶段需要管好水层，做到深浅适宜，以水调温调肥，防止因水温过高或长期深灌加重发病。⑥及时拔除病株后喷洒50%多菌灵可湿性粉剂600倍液加75%百菌清可湿性粉剂600倍液;也可用上述混合好的杀菌剂每公顷7.5kg拌细土375～450kg，堆闷3～4h后，撒入浅水层，2～3d后再用上述混合剂600倍液或40%多硫悬浮剂400倍液或50%速克灵可湿性粉剂1000倍液喷于地上部叶柄。
2、碗莲叶腐病
症状：主要为害浮贴水面的叶片，病斑形状不定形，有的呈“S”形，有的形如蚯蚓状，褐色或黑褐色，坏死部后期出现白色皱球状菌丝团，后生茶褐色球状的小菌核，发病重的叶片变褐腐烂，难于抽离水面。
传播途径和发病条件：以菌核随病残株遗落在土壤中越冬，翌年菌核漂浮水面，气温回升后菌核萌发产生菌丝侵害叶片，病菌发育适温25～30℃，温度高于39℃或低于15℃不利发病，夏秋高湿多雨季节易发病。
防治方法： ①减少菌源，采收时清除病残株，深埋或集中烧毁。②发病初期喷洒50%多菌灵可湿性粉剂800倍液或70%甲基硫菌灵可湿性粉剂800倍液或30%碱式硫酸铜悬浮剂500倍液，每隔10d左右喷一次，连续防治2～3次。
3、碗莲斑腐病
症状： 病斑形状不定，叶片上初生水渍状小黑斑点，后扩展成圆形至多角形或不规则形。边缘黑色有黄色晕圈的病斑，中间灰黑色有轮纹，病部易破裂或脱落，致叶片和叶缘残缺不整，严重时叶片大部分甚至全部变黑褐色腐烂，上生灰褐色霉层，即病菌子实体。
传播途径和发病条件：广东该病见于7～11月，8～9月受害严重。病菌以菌丝或厚垣孢子越冬，翌春产生分生孢子进行初侵染和再侵染，引起发病。
防治方法： ①生长季节收集病残物深埋或烧掉。②施足腐熟有机肥，适时适量追肥，做到有机肥和化肥相结合，氮肥与磷钾肥相结合。③及时拔除病株后喷洒50%多菌灵可湿性粉剂600倍液、75%百菌清可湿性粉剂600倍液、36%甲基硫菌灵悬浮剂500倍液、50%苯菌灵可湿性粉剂1500倍液或80%炭疽福美可湿性粉剂800倍液，每隔10d左右喷一次，连续防治2～3次。
4、碗莲炭疽病
症状： 叶片上发病，初生褐色小斑点，接着斑点扩大为10mm以上的近圆形病斑，病斑边缘色较暗。
传播途径：病菌在受害株组织上以分生孢子层越冬，空气传播。
防治方法： 防治方法可参考碗莲斑腐病
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